二代的死，官方漫画已有交待(团藏临死前的回忆)。

在忍界大战中(应为第一次)，二代与猿飞日斩、水户门炎、转寝小春、秋道取步、志村团藏、宇智波镜共七个人被云隐的金角部队围困住了，需要有一个人当诱饵来掩护大家。

猿飞和团藏都争着要去当诱饵，但最后二代决定自己当诱饵，临走前他任命猿飞为三代火影，并在之后的战斗中战死(具体怎么死的不详)。