合同与协议在法律上的区别如下：性质不同合同双方的意思都表示一致而达成的一种契约.简单地说，就是互利互惠,然后把都同意的事情固定下来，说明白，说清楚，而协议双方在合作经营合同期间，如遇未尽事宜，经友好协商取得一致意见后，可签订补充协议，协议具有同等的法律效力。

在履行本协议时，如发生分歧，双方尽量协商解决，如协商不成，任何一方均有权依法解决。

2、效力不同需要公证的协议只是把协议的效力固定并强化。

而合同的当事人也没有约定，是不需要特别的公证的。

合同或协议一般两份就够了。

合同当事人各持一份，如有第三份，很可能是给见证人或第三人，这个作用也是为了强化合同或协议的效力，由双方当事人约定的。

3、法律效应不同订立协议书，其目的是为了更好地从制度上乃至法律上，把双方协议所承担的责任固定下来。

作为一种能够明确彼此权利与义务、具有约束力的凭证性文书，协议书对当事人双方（或多方）都具有制约性，它能监督双方信守诺言、约束轻率反悔行为，它的作用，与合同基本相同。

而签合同目的为平等主体的自然人、法人、其他组织之间设立、变更、终止民事权利义务关系的协议。

婚姻、收养、监护等有关身份关系的协议，适用其他法律的规定。

参考资料来源：百度百科-合同百度百科-协议书。