士官长从博爱之城逃出来。

回到地球，抗击星萌入侵。

士官长带领精英和一部分人类追踪先知到达控制室，阻止先知启动环带。

此时虫族出现，联手士官长和神风干掉先知。

士官长在博爱之城找到柯塔娜。

杀到控制室，由于虫族，众人决定启动光环，随即与引导者发生冲突，士官长消灭了引导者。

与神风逃到黎明号中，全速返回地球，但由于传送门关闭，士官长在未知的宇宙空间中漂流。

星萌彻底解题，人类与部分精英达成停战协议。